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Rastreando genéticamente el origen de SARSCoV2

Este artículo describe los métodos empleados para rastrear diferentes linajes de coronavirus y como se pueden interpretar evolutivamente.

Analicemos los párrafos  resumen donde lxs autorxs interpretan sus resultados:

 

"SARS-CoV-2 itself is not a recombinant of any sarbecoviruses detected to date."

Empieza aclarando que el SARSCoV2 en sí  mismo no es ningún recombinante de ningún  sarbecovirus (un subgénero de coronavirus) detectado hasta la fecha.

 

"Zhou et al.2 concluded from the genetic proximity of SARS-CoV-2 to RaTG13 that a bat origin for the current COVID-19 outbreak is probable."

 Basándose en la proximidad genética del SARS-CoV-2 con otro cov de murciélago, el RaTG13 deducen que el origen del actual brote COVID-19 en los murciélagos es probable.

 

"Concurrent evidence also proposed pangolins as a potential intermediate species for SARS-CoV-2 emergence and suggested them as a potential reservoir species." 

 La evidencia existente propone a los pangolines como especie intermedia para la aparición  del  SARS-CoV-2 y los sugirió como especie reservorio.

 

Refiriéndose a la similitud genética  con los cov de murciélagos:

"This provides compelling support for the SARS-CoV-2 lineage being the consequence of a direct or nearly-direct zoonotic jump from bats, because the key ACE2-binding residues were present in viruses circulating in bats."

Esto supone un apoyo indiscutible para la teoría de que el linaje del SARS-CoV-2 es una consecuencia directa o casi directa de un salto zoonótico desde los murcielagos, porque los residuos clave de unión al receptor ACE-2 estaban presentes en virus que circulaban en murciélagos.

 

Sin embargo hay una secuencia de genes en los que estos 2 cov difieren en distancia genética:

"RaTG13 has acquired this region from a more divergent and undetected bat lineage. The genetic distances between SARS-CoV-2 and RaTG13 (bottom) demonstrate that their relationship is consistent across all regions except for the variable loop."

RaTG13 ha adquirido esta región  de un linaje no detectado y más divergente. Las distancias genéticas entre SARS-CoV-2 y RaTG13 demuestran que su relación es consistente por todas las regiones menos el bucle variable.

 

"Of importance for future spillover events is the appreciation that SARS-CoV-2 has emerged from the same horseshoe bat subgenus that harbours SARS-like coronaviruses..."

Es importante de cara a futuros pases a humanos tener en cuenta que el SARS-CoV-2 han emergido del mismo subgénero de murciélagos Rhinolopus que albergan cov tipo SARS...

 

A continuación, lxs autorxs justifican la necesidad de seguir estudiando estos cov de murciélagos:

"Another similarity between SARS-CoV and SARS-CoV-2 is their divergence time (40–70 years ago) from currently known extant bat virus lineages (Fig. 5). This long divergence period suggests there are unsampled virus lineages circulating in horseshoe bats that have zoonotic potential due to the ancestral position of the human-adapted contact residues in the SARS-CoV-2 RBD. Without better sampling, however, it is impossible to estimate whether or how many of these additional lineages exist."

 

Otra similitud entre (los linajes?) de SARS-CoV y SARS-CoV-2 es su tiempo de divergencia (hace 40-70 a) de linajes de virus de murciélagos hoy extintos. Este largo período de divergencia sugiere que hay linajes de virus no muestreados circulando en murciélagos  Rhinolopus que tienen potencial zoonótico debido a la posición  ancestral de los residuos de contacto adaptados a humanos en el dominio de unión  al receptor (RBD) del SARS-CoV-2. No obstante, sin un mejor muestreo es imposible estimar si o cuantos de esos linajes adicionales existen.

 

SIN EMBARGO HAY UN HALLAZGO PARA EL QUE, DE MOMENTO, NO HAN ENCONTRADO EXPLICACIÓN:

"Although the human ACE2-compatible RBD was very likely to have been present in a bat sarbecovirus lineage that ultimately led to SARS-CoV-2, this RBD sequence has hitherto been found in only a few pangolin viruses. Furthermore, the other key feature thought to be instrumental in the ability of SARS-CoV-2 to infect humans—a polybasic cleavage site insertion in the S protein—has not yet been seen in another close bat relative of the SARS-CoV-2 virus."

Aunque el RBD al ACE2 humano es muy probable que estuviera presente en un linaje de sarbecovirus de murciélagos que condujo al final al SARS-CoV-2, esta secuencia del RBD solo se ha encontrado hasta la fecha en algunos virus de pangolín. Más aún, el otro detalle clave que se considera instrumental en la habilidad del SARS-CoV-2 de infectar humanos - una inserción polibásica en el sitio de clivaje en la proteina S - no se ha encontrado todavía en otro pariente cercano de murciélago  del virus SARS-CoV-2.

 

En el ultimo párrafo, lxs autorxs desvelan sus intenciones:

"The existing diversity and dynamic process of recombination amongst lineages in the bat reservoir demonstrate how difficult it will be to identify viruses with potential to cause major human outbreaks before they emerge. This underscores the need for a global network of real-time human disease surveillance systems, such as that which identified the unusual cluster of pneumonia in Wuhan in December 2019, with the capacity to rapidly deploy genomic tools and functional studies for pathogen identification and characterization."

 

La diversidad existente y el proceso dinámico entre los linajes en el reservorio de murciélagos  demuestran lo difícil  que será identificar virus con potencial para causar grandes brotes en humanos antes de que emerjan. Esto remarca la necesidad de una red global de sistemas de vigilancia de enfermedades humanas, en tiempo real tal y como la que identificó  el brote de neumonía  en Wuhan en diciembre de 2019, con la capacidad de desplegar herramientas genómicas y estudios funcionales para identificación y caracterización de patógenos.

¿No suena esto a lo ya explicado en la sección principal?

PÓNGASE  LA EXCUSA DE PREVENIR EL PELIGRO DE UNA PANDEMIA CREANDO LOS RIESGOS PARA QUE ÉSTA APAREZCA... ES DECIR PRIMERO SE CREA EL PROBLEMA Y LUEGO SE OFRECE LA "SOLUCIÓN" QUE, COMO YA IREMOS VIENDO, OFRECE SUS PROPIOS RIESGOS Y PROBLEMAS.

 

 

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Comentarios

29.10 | 00:39

Me ha encantado , ya hablaremos cuando tengas tiempo

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06.09 | 02:08

matrix agroganadero, jajaja, toda la razóm. La natura siempre se organizó a si misma para todo lo que cayera al suelo se aprovechara.

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01.08 | 12:49

Hola Carmen soy Antonia, quisiera me metas en el grupo de whatsapp con el 699769996 el frances lo he dado de baja.
Muchad Gracias.

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12.10 | 09:31

Increíblemente interesante, voy a estudiarlo en detalle. Gracias.

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